Lễ bốc thăm được tiến hành bởi Hiệp hội Bóng đá Estonia vào ngày 30 tháng 5 năm 2015, vào giữa giờ trong trận chung kết mùa giải 2014–15.[1]

• Rahvaliiga (RL) là giải đấu được tổ chức bởi Hiệp hội Bóng đá Estonia, nhưng không thuộc hệ thống giải chính.

• Ghi chú 1: Saue JK Laagri bỏ giải.

Đội miễn đấu

Các đội sau không được bốc thăm và vào vòng Hai mà không cần thi đấu:

• Meistriliiga (Cấp độ 1): Nõmme Kalju FC, Tallinna FC Flora, JK Sillamäe Kalev, Pärnu Linnameeskond,
• Esiliiga (2): Tartu FC Santos, Rakvere JK Tarvas
• Esiliiga B (3): Kohtla-Järve JK Järve,
• II Liiga (4): Tartu JK Welco, Tallinna JK Legion, Viimsi MRJK,
• III Liiga (5): Maardu FC Starbunker II, JK Loo, FC Järva-Jaani, Ambla Vallameeskond, Tallinna SK Dnipro, JK Tallinna Kalev III, Tartu FC Merkuur, FC Otepää, EMÜ SK, Läänemaa JK Haapsalu,
• IV Liiga (6): Tabivere RSK, Tallinna Jalgpalliselts,
• Rahvaliiga (RL): Õismäe Torm, Lootos FCR, JK Fellin